Lagos State er et knutepunkt for den verdensberømte universiteter. De mest anerkjente universiteter er Lagos State University, Caleb University, og Yaba College of Technology. Disse høye rangert universiteter tilbyr avanserte studier til utenlandske studenter i hundrevis av disipliner, og derfor er Lagos State ideell for høyere utdanning.

For å få plass på de nigerianske universiteter (både offentlige og private universiteter er i hver stat i føderasjonen inkludert FCT), har en potensiell student å sitte for og lykkes bestå UME (universiteter artium) som administreres av Jamb (Joint Entre og studiekompetanse Board). Også enkelte universiteter regelmessig skjermen potensielle kandidater til å sørge for at de er på linje for universitetsnivå arbeid i Nigeria.

Master of Science grader er avanserte akademiske programmer som tilbys ved høgskoler og universiteter for studenter som allerede har oppnådd en bachelorgrad. Tjene en mastergrad kan føre til større faglige og personlige muligheter for nyutdannede.